如果全部放在研发支出-资本化支出里面，等到日后无形资产形成，是要计入无形资产的成本中的。如你所说，你发生的费用是为了研发某种无形资产而发生的费用，如果是研究阶段，一般是最后都是转入当期费用的，如果是开发阶段，属于资本化都最后将转入无形资产成本，如果是费用化的，最后也会于当期转入损益中。
你如果把什么都放入研发支出-资本化科目中，除非说明你公司正在研究一无形资产，并且所发生的费用都是与该资产直接相关。如果不是，肯定是有问题的。
另外如果放入该科目，以后会形成一公司资产，会按期摊销，影响公司利润会比较均衡。
你说的那些日常费用，也要看实际情况，如果是和研发直接相关的可以入研发支出中，倘若不是的，我建议还是按照会计相关制度，计入当期损益中，比如管理费用等。
软件行业都会有自己的研发流程，如调研、规划、需求、开发、测试等，一般来说项目进入了开发阶段才能将发生的费用计入研发支出-资本化科目，前期的应该都属于费用化支出，日常的房租、交通、差旅等应该要根据报销人的所属部门来归集，如果是管理人员报销那就计入管理费用，如果是研发人员的那就资本化
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