（1）基因工程中使用的限制酶，其特点是特异性地识别和切割DNA．
（2）用限制酶E1切开质粒X-1后，质粒X-1暴露出两个粘性末端，APr被切下．两端用E1切开的Tcr基因含有与上述切割后的质粒X-1，Apr含有相同的粘性末端，混合后可形成X-1、X-2和X-3．
（3）含质粒X-1的细胞可在含青霉素培养基上生长，含质粒X-2的细胞可在含四环素培养基上生长；含质粒X-3的细胞不含抗性基因，不能在两种培养基上生长；不含有质粒的细胞也不能在两种培养基上生长．
（4）X-2的长度为1200+3550=4750，用E2酶切后质粒由环状变为链状．
（5）两段DNA粘性末端相同，DNA连接酶对DNA片段没有选择性，故增大DNA连接酶用量不能提高上述比例．
故答案为：
（1）特异性地识别和切割DNA
（2）ABC
（3）无质粒的细胞 含X-3的细胞
（4）4750
（5）不能 DNA连接酶对DNA片段没有选择性/两段DNA末端相同
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