看图层面板里当前选择的图层是不是你要编辑的图层。如果不是，点一下你要编辑的那层，再用魔棒。
如果是，把容差改下，不然就用套索，或者通道。
魔棒工具有容差这个概念的，里面输入的数字越大，简单地讲得到的选择范围就越大；反之就越小，你可以输入小点的数值来达到自己的目的。
因为魔棒有容差的。 再加上你选的块也不对
1. 查看你的当选图层，是不是你要编辑的图层；
2. 看容差
1000多个图并接是不成问题的，但是别弄1000个图层了在合并因为那样会占很大的内存的，建议你一边接一边合并。
还有你一次打开太多图像是很慢的，还有你要设置PS处理大图形（把不处理200MB以上文件的选项去掉）。因为我也经常处理好多图层的。
你看你的容差选择的是多少，小一点就可以，可以根据你的选择
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