学校扣押学生学籍，不给学生转学是不合法的。
《中小学生学籍管理办法》第二十七条规定，学校违反本办法的规定，有下列情形之一的，由主管部门责令改正；情节严重的，依法追究校长和相关人员责任：
一、不为已接收学生建立学籍档案的。
二、以虚假信息建立学籍或学籍档案的。
三、不及时把学籍变动信息纳入学籍档案的。
四、不及时报告义务教育阶段学生辍学情况的。
五、接收学生不为其办理转学手续的。
六、不按规定为学生转接学籍档案的。
七、泄露或非法使用学生学籍信息的。
学校扣押学生学籍，属于上述第六条：不按规定为学生转接学籍档案的情形，学生可以去教育局要求学校责令改正。
扩展资料：
学生转学的学籍规定：
一、学生转学或升学的，转入学校应通过电子学籍系统启动学籍转接手续，转出学校及双方学校学籍主管部门予以核办。
二、转入、转出学校和双方学校学籍主管部门应当分别在10个工作日内完成学生学籍转接。
三、学生办理学籍转接手续后，转出学校应及时转出学籍档案，并在1个月内办结。
四、学生转学或升学后，转入学校应当以收到的学籍档案为基础为学生接续档案。
参考资料来源：百度百科-中小学生学籍管理办法
有转学的权利是肯定的，先上教育局投诉，再要是解决不了，上法院告他去
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