男主角叶湘伦(周杰伦)女主角叶小雨(桂纶镁)故事前期是讲湘伦新生来到学院进一个钢琴室时听到优美的琴声,正好同学告诉他要坼了。然后他寻着声音到了间钢琴室见到了叶小雨,虽然简单询问了下但彼此也有了好感,后来在上课的时候湘伦以为小雨是同班的还老迟到,然后两人结伴而行有说有笑,湘伦为送给小雨礼物参加斗琴赛得到天鹅音谱送给小雨后来承诺给小雨在毕业典礼上专门为小雨谈琴。有次湘伦上课传纸条给最后排的小雨但纸条却给了后排那个女生(忘名字了)(秘密也慢慢解开了),约在晚上7点半见面误亲了那个女生,然后小雨也看见了气跑了,消失5个月后毕业典礼上小雨也来看湘伦的琴奏,湘伦看见后,小雨哭着走咯,湘伦直接跑出去追上去,然后拥抱后小雨又消失了。直到后来才知道小雨是20年前的等于是穿越时空遇见相爱(换句话来说20前的她和现在湘伦时间都在移动只是她能穿梭时空看见湘伦)最后结局应该是两人都死了在幻想空间里重逢相爱。。(具体还要楼主观看咯,很感人,剧情不看完很难懂)
《不能说的秘密》讲述的是一段发生在钢琴天才小伦与路小雨之间的奇幻爱情故事。小伦转学到了一所艺术学校,在学校的旧钢琴房里,他第一次见到了神秘的路小雨。路小雨是1979年就读于淡江中学的学生,她是个音乐天才,但视力逐渐衰退。她通过在钢琴底下发现的一首名为《秘密》的琴谱,用这台钢琴穿越时空来到了20年后的学校,遇到了新转校生叶湘伦。
叶湘伦是小伦的同班同学,他们因为音乐而相识,并在过程中慢慢产生感情。但小雨每次穿越有时间限制,而叶湘伦每天也要去琴房弹琴,每次穿越有时间限制。所以两人每次见面都十分珍贵。他们共同保守着一个秘密,那就是小雨的存在和穿越时空的秘密。
在故事的最后,当叶湘伦奔向路小雨的时候,他想弹琴回到他们第一次见面的那一天,而小雨也将如何穿越的秘密写在琴谱上,留给了叶湘伦。故事以叶湘伦在毕业典礼上弹奏《不能说的秘密》而结束。