关于柯南的主线剧情

主线：

1 云霄飞车杀人事件（Gin&Vodka初次登场，让新缩小变成了柯南）

2 董事长千金绑架事件（阿笠博士知道柯南身份，工藤新一化名江户川柯南，转入帝丹小学。）

4 大都会暗号地图事件(少年侦探团成立)

13 奇怪的寻亲杀人事件（宫野明美被警察逮捕）

43 江户川柯南诱拐事件(工藤夫妇得知柯南身份。)

48-49外交官杀人事件（服部平次登场,新一第一次回复）

52雾天狗传说杀人事件（柯南得知了琴酒和伏特加的代号） 54 电玩公司杀人事件（Tequila登场,被炸死）
57-58 福尔摩斯迷杀人事件(服部发现柯南身份）
128 黑衣组织十亿元抢劫事件（宫野明美被组织杀害）
129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件（灰原登场亮相。柯南第一次知道了药的名字是APTX4869）

170-171黑暗中的死角（新出智明的父亲被其继母杀害，在柯南的协助下破案。新出正式登场）

176-178与黑衣组织的再会（灰原解释了APTX4869原来是细胞程序性死亡。Vermouth在这里第一次露面。皮斯克与灰原的父母很熟悉，药的开发在灰原父亲的时代就开始了。GIN提到了“那位先生”，在以后会经常出现。灰原第一次恢复）
188-193 危命的复活（新一第二次恢复）

226-227格斗游戏的陷阱（茱蒂首次登场并与柯南相识，并看见他借助园子破案。）

230-231神秘的乘客（Vermouth再次露面，假扮新出与灰原同车。赤井秀一出场）

242 元太的灾难（灰原哀提到琴酒是左撇子。）

253-254 本厅刑事恋爱物语4（新出医生（贝尔摩得假扮）可能发现了柯南分析案情并利用变声器。）

258-259来自芝加哥的男子（詹姆斯·布莱克登场）

269-270犯罪的遗物（贝尔摩得偷走与毛利小五郎相关案卷，为了解新出的案子，并把FBI的注意力转向毛利，片尾赤井秀一监视侦探事务所，贝尔摩得计划得逞）
271-272 隐藏匆忙中的省略（茱蒂在谈话中暗示柯南其身份已经暴露，并且提到了FBI；在案件中兰回想起自己曾经见到过”带黑色针织帽的男子”（赤井秀一）；在故事结尾贝尔摩德发邮件给琴酒，提到了雪莉酒，并且向打了叉的宫野志保的照片发飞镖，旁边还有柯南和兰的照片）。
277-278 英语教师VS西部名侦探（柯南基本肯定了克里丝是组织的成员，并进一步怀疑茱蒂=克里丝，并与服部平次一起去茱蒂公寓试探，未果。在最后茱蒂的浴室的镜子后面出现的柯南和兰的照片，并且照片上的字迹和贝尔摩德的一模一样。柯南最后说的除茱蒂外的另两个可疑人物应该是赤井和新出。）
286-288 工藤新一NY事件（兰和新一救了Vermouth假扮的银发杀人魔。毛利兰初见赤井秀一）
289-290 光彦森林迷失记（灰原透露沼渊己一郎是组织成员）
307-308 遗留的无声证言(小五郎受托寻找失踪的电脑工程师板仓卓，从委托人的谈话中柯南了解到他就是当年在电玩公司杀人事件中被炸死的组织成员龙舌兰接触的对象。最后通过追查案件，柯南获得了组织的线索——板仓的日记)
309-311 与黑衣组织的接触（黑衣组织再度出场，柯南和GIN的第一次正面交手，柯南一度陷入危机，可最后不知是GIN放水还是疏忽，柯南侥幸逃过一劫。）

329-330金钱买不到的友情(阿笠博士提到哀的父亲宫野厚司是一个很有名的疯狂科学家，而母亲艾莲娜是一个英国留学生，并且黑衣组织可能正在从事让死人复活的计划。)

335-336 东都现象所的秘密(赤井秀一跟踪柯南和灰原，最后赤井对着哀的照片说了一句“真是太像了”暗示他和哀以前就曾相识)

338-339四台保时捷（博士借茱蒂的车将灰原送回了家，并找来新出医生给感冒发烧的灰原看病。Vermouth和茱蒂都发现灰原住处）
340-341 厕所里隐藏的秘密（灰原在父亲好友的设计所厕所里发现了姐姐留给自已的录音带。贝尔摩德在博士家安装窃听器，之后贝尔摩德打电话找组织成员“卡尔多瓦斯”来帮忙，正策划着某项行动。）

343-344便利商店的陷阱（茱蒂辞去了帝丹高中的老师的职务，不过在兰和园子到茱蒂家中开聚会时，兰意外发现了镜子背后的照片）
345 与黑衣组织的直面对决 满月之夜的二元推理（vermouth，茱蒂等人身份揭露，vermouth放弃追捕雪莉，并且向琴酒隐瞒了柯南和哀的事同时柯南听到了贝尔摩德给那位先生发邮件时的按键音。）

346-347寻找屁股上的印记（灰原哀拒绝了证人保护计划。）

361-362 帝丹高中校园灵异事件（真正的新出医生回归。）

374-375 星星和香烟的暗号（山村操给他奶奶发信息，开头按键音和Boss的邮件地址很像，是鸟取县）

385-387斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（柯南知道boss的邮箱号，为七个孩子）

394-396奇异屋宇大冒险（柯南已经得知boss的手机号）
425 黑色冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间（Kir、Chianti、Korn登场。黑衣组织的杀人计划遭到FBI和柯南阻止，Kir受伤昏迷，被FBI捕获。）

429-430无法回头的二人（本堂瑛祐登场。）

462-465黑衣组织的影子（柯南注意到贝尔摩德去水无怜奈出事的目击者家询问，本堂瑛祐在到毛利侦探事务所做客时有意无意的把话题引向水无怜奈，并希望柯南等人前去调查）
484-485 黑色照片的去向（柯南和灰原哀进行调查，得到一张本堂瑛祐父亲的照片）
491-504 红与黑的碰撞（小兰的新同班同学本堂瑛佑总给柯南不好的感觉，他四处寻找自己的姐姐本堂瑛海，本堂瑛海与水无怜奈长相一摸一样，但是血型不对。黑衣组织四处寻找水无怜奈，得到FBI帮助的水无怜奈假装昏迷不醒，被本堂瑛佑袭击后不得不说出真实身份，原来水无怜奈就是本堂瑛海，代替被杀的父亲成为CIA的卧底，水无怜奈答应赤井秀一重新返回组织，但是接到的第一个任务就是杀死赤井秀一。赤井秀一疑似牺牲。）

507-508卡拉OK包房的死角（本堂瑛祐知道柯南身份，打算离开日本，柯南对赤井秀一已死的举动奇怪。）

509 红白黄色与侦探团 F/C（水无怜奈向茱蒂透漏情报，组织派出了一个厉害的侦探波本。冲矢昴登场，搬进工藤新一的房子。）

510 柯南VS双重暗号之谜

511 推理对决！新一VS冲矢昴（柯南发现冲矢昴的推理能力很强，而且是左撇子，爱喝波本酒。）

521 杀人犯 工藤新一

522 新一的真实身份与小兰的眼泪

523 真正想问的事 （新一第三次恢复）

542-543鱼儿消失的一角岩（灰原哀再次感到冲矢昴的压迫感。）

563-564侦探团VS劫匪团（脸上带着烧伤的伤疤、疑似赤井秀一的人出现，右眼有着明显的被火烧伤的伤疤。在最后此人捡起了抢劫犯的手枪，在柯南被抢劫犯劫持的紧张时刻，开枪救了柯南。）
578 召唤危机的红色前兆
579 黑色与13的暗示
580 逼近的黑之时限
581 摇曳的红色目标（疑似赤井秀一的人再度出现，同时，在商场的茱蒂老师收到了“这里很危险，快逃”的字条，此时冲矢昴也在商场，首次见到了伤疤男，说的话意味深长。伤疤男将在商场发生的案件的推理用别人的手机发给了毛利小五郎。琴酒以及基安蒂等人欲检验赤井秀一是否生还，并以此来证实基尔是否是卧底，却被柯南巧妙地引开。与此同时昴也在寻找伤疤男，而伤疤男却在被瞄准时对着瞄准镜露出诡异的笑容。）

616-621福尔摩斯的默示录（新一第四次恢复，并向兰告白。工藤夫妇知道灰原哀是APTX4869的研发者。）

622-623紧急事态252（阿笠博士被绑架，片尾灰原哀再次对冲矢昴表示强烈怀疑。）

646-647幽灵旅馆的推理对决（世良真纯登场）

651 柯南VS平次 东西侦探推理对决（茱蒂、卡迈尔在看到世良的照片后表示世良“很像某个人”，而詹姆斯则一眼看出世良是女孩子。）

656-657博士的视频网站（世良看到博士视频中印出来的灰原哀的影子，并向光彦、元太打听了“博士家的小女孩”（即灰原哀）、邻居（即冲矢昴）的情况。并对着冲矢昴的窗户说：“我还以为是谁随随便便地住进来了呢，不过现在看起来真是杞人忧天了啊……”最后世良将视频中意外拍到的灰原影像在电脑中删除。）

667-668婚礼前夜（安室透登场，成为小五郎弟子。）
671-674 侦探们的夜想曲（冲矢昴脱口而出的一句“不要露出那种表情”，似乎让灰原感到相当在意。Vermouth给波本打电话，安室透，冲矢昴，世良真纯同时接到电话）
675-676 一丁点都不原谅(灰原回想起冲矢的那句“不要露出那种表情”，和曾在组织卧底的诸星大（即赤井秀一）的用语十分相似。世良真纯对工藤新一似乎早有了解，对灰原哀表现出兴趣，并关注伤疤秀一)
681-683 以性命为赌注的恋爱转播（结尾处安室透为高木的指导警官伊达扫墓，暗示两人曾是朋友)
684-685 泡沫、蒸汽和香烟（灰原的举动和二人对话表示，冲矢的颈部隐藏着某个秘密）
690-691 工藤优作未解决的事件（冲矢昴举止可疑，世良在房间中发现了女性线索，最后世良含泪回望柯南和兰，说：“果然我是个坏孩子呢。”）
699-700 逼近灰原秘密的黑影（侦探团被困，灰原迫不得已服解药恢复身体，被光彦拍下视频，被世良、安室、冲矢看到。）
701-704 漆黑的特快列车（世良真纯，安室透身份揭晓。黑衣组织再次出场，目标雪莉。怪盗基德受柯南所托假扮宫野志保进入最后一节车厢，车厢脱落后，贝尔摩德引爆炸药，基德乘滑翔翼逃走。后贝尔摩德发现Sherry没死但未向组织报告。安室透对赤井之死产生怀疑，准备重新调查。冲矢昴露出与赤井秀一相同的眼神。）

705 密室中的柯南 （波本继续以安室透的身份出现）

706 在波本面前解谜（波本发现柯南使用手表型麻醉针，对其产生兴趣，并怀疑“沉睡的小五郎”与柯南之间的联系）
《通往天国的倒计时》（柯南一行人在露营的回家途中顺道参观一座位于西多摩市境内即将在近期完成的全日本最高双塔摩天大楼。而这摩天大楼的所有者同时也邀请了小五郎与小兰前来参加开幕典礼，因而与柯南一行人偶然巧遇。不久发生了杀人事件。同时黑衣组织登场，制造了爆炸，想要炸死雪莉。兰，柯南以及少年侦探团火里逃生。）
《漆黑的追踪者》（梅雨季刚结束不久，在东京、神奈川、静冈、长野等地发生了一共6起杀人事件。由於被害者身边都遗留著神秘的麻将牌，因此被认定为由同一嫌犯或组织所犯下的大范围连续杀人事件。同时黑衣组织出场，柯南在东京铁塔与组织对抗）

　　580 紧迫黑色的时限（Kir被怀疑身份，琴酒准备让基安蒂狙击疑似秀一的人）
581 摇摆的红色目标（冲矢昴称组织为‘笨狼’，对柯南似乎很了解，言语中好像对柯南传递了某些信息似的；狙击失败，boss命令撤退）
582 僵尸死亡之夜◆
583 小林老师之恋
584 白鸟警部的失恋
585 跨越时空的樱花之恋 K
586
黑暗中消失的麒麟之角 K
587 基德VS四神侦探团 K
588 屋顶农场的陷阱◆
589 最糟糕的生日（前篇）
590
最糟糕的生日（后篇）
591 家中的水族馆◆
592 猴子与熊手的酉之市侦探物语（前篇）
593
猴子与熊手的酉之市侦探物语（后篇）
594 广岛宫岛的七大不可思议之旅（宫岛篇）◆
595
广岛宫岛的七大不可思议之旅（广岛篇）◆
596 坠落的不在场证明◆
597 蒸汽密室的剧本（前篇）
598
蒸汽密室的剧本（后篇）
599 正义的伙伴◆
600 梦中遇见河童（前篇）
601
梦中遇见河童（后篇）
2011年（602－641）
602 潜伏在网球场的恶魔◆
603
降灵会双重密室事件（第一密室）◆
604 降灵会双重密室事件（第二密室）◆
605 降灵会双重密室事件（密室开放）◆
606
法庭的对决Ⅳ 陪审员小林澄子（前篇）◆
607 法庭的对决Ⅳ 陪审员小林澄子（后篇）◆
608 背叛的白色情人节（前篇）
609
背叛的白色情人节（后篇）
610 被害者是工藤伸壹 X
611 犬伏城 炎之魔犬（鬼火之章） X
612 犬伏城
炎之魔犬（足迹之章） X
613 犬伏城 炎之魔犬（公主之章） X
614 日记演奏的秘密（前篇）
615
日记演奏的秘密（后篇）
616 福尔摩斯启示录（名侦探的弟子）（工藤新一第四次恢复，并在此系列中向兰告白）
617 福尔摩斯启示录（Love is 0）
618 福尔摩斯启示录（撒旦）
619 福尔摩斯启示录（Code breack）
620 福尔摩斯启示录（草场女王）
621 福尔摩斯启示录（0 is start）（工藤新一留下出境、入境记录，可能成为以后的伏笔）
623 紧急事件252（后篇）（冲矢昴身手不凡，击晕歹徒，却谎称歹徒自己摔倒。）
624 初恋的视频信件（哀与柯南提及冲矢昂，哀说他神出鬼没，柯南依旧很放心）
625 惊叫手术室（前篇）
　　626 惊叫手术室（后篇）
　　627 柯南基德的龙马宝物攻防战（前篇） K
　　628
柯南基德的龙马宝物攻防战（后篇） K
　　629 宣传片拍摄事件（前篇）◆
　　630 宣传片拍摄事件（后篇）◆
　　631
花时钟知道一切◆
　　632 时间守护者的剑（前篇）
　　633 时间守护者的剑（后篇）
　　634 犯罪现场在超狭小的店◆
　　635
减肥时要当心◆
　　636 世界上最想学习的课程事件（前篇）◆
　　637 世界上最想学习的课程事件（后篇）◆
　　638
在红叶御殿解开谜题（前篇）◆
　　639 在红叶御殿解开谜题（后篇）◆
　　640 8枚素描记忆之旅（冈山篇）◆
　　641
8枚素描记忆之旅（仓敷篇）◆
2012年（642－）
　　642 和歌纸牌千钧一发（前篇）
　　643
和歌纸牌千钧一发（后篇）
　　644 好吃得要死的拉面（前篇）
　　645 好吃得要死的拉面（后篇）
646 幽灵旅馆的推理对决（前篇）（世良真纯初登场）　
647 幽灵旅馆的推理对决（后篇）
648 侦探事务所笼城事件（爆发）（世良真纯接触毛利事务所，柯南对世良是似成相识的感觉）　
649 侦探事务所笼城事件（狙击）
650 侦探事务所围困事件（解放）
651 柯南VS平次 东西侦探推理对决(FBI、平次、柯南，世良同台出场，卡梅隆表示好像在哪里见过世良，朱蒂说世良与某人相似，而詹姆斯则一眼认出世良是女的，更加可疑。）
652 毒药与幻影的设计（EYE） X
653 毒药与幻影的设计（S） X
654 毒药与幻影的设计（Poison） X
655
毒药与幻影的设计（Illusion） X
656 博士上传的视频（前篇）（冲矢昴跟踪侦探团）
657 博士上传的视频（后篇）（世良帮忙删去了可能暴露灰原哀的视频）
658 巧克力的炙热陷阱◆
659 与初恋的共同搜查（前篇）
660 与初恋的共同搜查（后篇）
661
小五郎是好人（前篇）
662 小五郎是好人（后篇）
663 追逐深山锹形虫◆
664 名犬Cool的功劳2◆
665
疑惑的姓名首字母K◆（2012年7月21日播出）
666 雨夜的恐吓犯◆（2012年7月28日播出）
667 婚礼前夕（前篇）
668 婚礼前夕（后篇）
671 侦探们的夜想曲（事件）
672 侦探们的夜想曲（诱拐）
673 侦探们的夜想曲（推理）
674 侦探们的夜想曲（波本）
675 一丁点都不原谅（前篇）
676 一丁点都不原谅（后篇）
683 命悬一线的恋爱转播（现场突入）

693【681】命悬一线的恋爱转播（转播开始）
694【682】命悬一线的恋爱转播（危在旦夕）
695【683】命悬一线的恋爱转播（现场突击）
696【684】泡沫、热气和烟（前篇）
697【685】泡沫、热气和烟（后篇）
698【686】装载了定时炸弹的汽车 ◆
696【687】谁都解不开冰冻的圈套 ◆
697【688】高木警官捡到3000万 ◆【
698【689】来自委托人的留言 ◆
699【690】工藤优作未解决的事件（前篇
700【691】工藤优作未解决的事件（后篇
701【692】隅田川的夜樱风景线（上集）
702【693】隅田川的夜樱风景线（下集）
703【694】消失老店的日式点心
704【695】葡萄园里的玫瑰花
705【696】花坛破坏者的阴谋
706【697】女子学园的窗口
707【698】相信吗！UFO 堕落事件
708【699】逼近灰原秘密的黑影（上集）
709【700】逼近灰原秘密的黑影（下集)
【重播307】 没有留下声音的证据（上集）
【重播308】 没有留下声音的证据（下集）
伪712【701】漆黑的特快列车（发车） ◆ 【2013年7月13日】
伪713【702】漆黑的特快列车（隧道） ◆ 【2013年7月20日】
伪714【703】漆黑的特快列车（交叉） ◆ 【2013年7月27日】
伪715【704】漆黑的特快列车（终点） ◆ 【2013年8月3日】
伪716【705】密室中的柯南（上集) 【2013年8月10日】
伪717【706】密室中的柯南（下集) 【2013年8月17日】

前面数值为伪集数（伪集数可能有出入）【就是包括基德的】，后面【】里面的是真正集数

剧场版
Movie_01. 引爆摩天楼 [1997]
Movie_02. 十四番的目标 [1998]
Movie_03. 世纪末的魔术师 [1999]
Movie_04. 瞳孔中的暗杀者 [2000]
Movie_05. 通往天国的倒计时 [2001]
Movie_06. 贝克街的亡灵 [2002]
Movie_07. 迷宫的十字路 [2003]
Movie_08. 银翼的魔术师 [2004]
Movie_09. 水平线上的阴谋 [2005]
Movie_10. 侦探们的镇魂歌 [2006]
Movie_11. 蔚蓝的灵柩 [2007]
Movie_12. 战栗的乐谱 [2008]
Movie_13. 漆黑的追踪者 [2009]
Movie_14. 天空的遇难船 [2010]
Movie_15. 沉默的15分钟 [2011]
Movie_16. 第11位前锋 [2012]
Movie_17. 绝海的侦探 [2013.4.20]
TV特别版

特别篇01-钢琴奏鸣曲"月光"杀人事件
特别篇02-雾天狗传说杀人事件
特别篇03-柯南对怪盗基德
特别篇04-走头无路的名侦探！连续两大杀人事件
特别篇05-浪花连续杀人事件
特别篇06-来自黑暗组织的女子！大学教授杀人事件
特别篇07-飞行中的密室！工藤新一首次事件
特别篇08-第二十年的杀机！圣佛尼号连续杀人事件
特别篇09-诅咒假面的冷笑
特别篇10-朝向迷宫的入口！巨神像之怒
特别篇11-名侦探的会集！新一vs怪盗基德
特别篇12-大阪双谜！浪花剑士与太阁之城
特别篇13-震动的警视厅！1200万人质
特别篇14-豪斯登堡的新娘
特别篇15-直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘事件
特别篇16-怪盗基德的惊异的空中步行
特别篇17-甲子园的奇迹 绝不能输给看不见的恶魔
特别篇18-黑色冲击 ! 组织之手伸来的瞬间
特别篇19-本厅刑事恋爱物语！虚假的结婚典礼
特别篇20-金比罗剧场的怪人
特别篇21-与服部平次在一起的三天
特别篇22-本厅刑事恋爱物语！左手的无名指
特别篇23-电视台的恶魔
特别篇24-法庭对决Ⅲ 目击者是检察官
特别篇25-服部平次VS工藤新一 滑雪场的推理对决
特别篇26-怪盗基德的瞬间移动魔术
特别篇27-风林火山 迷宫的铠甲武士
特别篇28-杀人犯 工藤新一
特别篇29-新一的真实身份与兰的眼泪
特别篇30-柯南VS平次 东西侦探推理对决

魔术快斗特辑：
1 怪盗基德诞生的秘密
2 怪盗基德夏日祭 怪盗基德忙碌的约会
3 怪盗基德夏日祭 公主殿下爱魔术
4 怪盗基德特别篇 魔女不流眼泪
5 怪盗基德特别篇 命运的蓝色生日
6 怪盗基德特别篇 恋爱滑雪场的圣诞夜
7 怪盗基德夏日祭 魔术快斗~华丽的对手们~
8 怪盗基德夏日祭 红色之泪的秘密
9 怪盗基德特别篇 魔女与侦探与怪盗
10 魔术快斗 追忆的黄金之眼
11 魔术快斗 泪之水晶之母
12 魔术快斗 暗夜骑士爱的眼泪
OVA
OVA_01. 柯南 VS 基德 VS 阿剑 宝刀争夺大作战! [2001]
OVA_02. 16名嫌疑犯 [2002]
OVA_03. 柯南、平次与消失的少年 [2003]
OVA_04. 柯南与基德与水晶之母 [2004]
OVA_05. 目标是小五郎！少年侦探团的秘密调查 [2005]
OVA_06. 追踪消失的钻石！柯南&平次 VS KID [2006]
OVA_07. 来自阿笠的挑战书！阿笠 VS 柯南&少年侦探团 [2007]
OVA_08. 女子高中生侦探铃木园子的事件簿 [2008]
OVA_09. 十年后的陌生人 [2009]
OVA_10. 怪盗基德 陷阱之岛 [2010]
OVA_11. 来自伦敦的绝密指令 [2011]
OVA_12. 传说中的球棒的奇迹 [2012]

SP
SP_01. 钢琴奏鸣曲"月光"杀人事件（1小时特别篇）[1996]
SP_02. 雾天狗传说杀人事件（1小时特别篇）[1997]
SP_03. 柯南 VS 怪盗基德（1小时特别篇）[1997]
SP_04. 走头无路的名侦探！连续两大杀人事件（2小时特别篇）[1998]
SP_05. 浪花连续杀人事件（1小时特别篇）[1998]
SP_06. 来自黑暗组织的女子！大学教授杀人事件（2小时特别篇）[1999]
SP_07. 飞行中的密室！工藤新一首次事件（1小时特别篇）[1999]
SP_08. 二十年的杀机！圣佛尼号连续杀人事件（2小时特别篇）[2000]
SP_09. 诅咒假面的冷笑（1小时特别篇）[2000]
SP_10. 朝向迷宫的入口！巨神像之怒（1小时特别篇）[2000]
SP_11. 名侦探的会集！新一 VS 怪盗基德（2小时特别篇）[2001]
SP_12. 大阪双谜！浪花剑士与太阁之城（2小时特别篇）[2002]
SP_13. 震动的警视厅！1200万人质（2小时特别篇）[2003]
SP_14. 豪斯登堡的新娘（1小时特别篇）[2003]
SP_15. 直面黑色组织的对决！满月之夜的双重迷案（2个半小时特别篇）[2004]
SP_16. 怪盗基德的惊异的空中漫步（1小时特别篇）[2004]
SP_17. 甲子园的奇迹 向无形的恶魔挑战（2小时特别篇）[2004]
SP_18. 黑色冲击! 黑暗组织的魔掌触碰的瞬间（2个半小时特别篇）[2006]
SP_19. 总局刑警恋爱物语！伪装的婚礼（1小时特别篇）[2006]
SP_20. 金比罗剧场的怪人（1小时特别篇）[2006]
SP_21. 与服部平次在一起的三天（2小时特别篇）[2007]
SP_22. 总局刑警恋爱物语8 左手的无名指（1小时特别篇）[2007]
SP_23. 电视台的恶魔（1小时特别篇）[2007]
SP_24. 法庭对决Ⅲ 目击者是检察官（1小时特别篇）[2007]
SP_25. 服部平次 VS 工藤新一 滑雪场的推理对决（1小时特别篇）[2007]
SP_26. 怪盗基德的瞬间移动魔术（1小时特别篇）[2008]
SP_27. 风林火山 迷宫的铠甲武士（1小时特别篇）[2008]
SP_28. 杀人犯 工藤新一（1小时特别篇）[2009]
SP_29. 新一的真面目与兰的眼泪（1小时特别篇）[2009]
SP_30. 鲁邦三世 VS 柯南（2小时特别篇）[2009]

581 红色的摇摆目标
616 福尔摩斯的默示录（名侦探的弟子） 　　
617 福尔摩斯的默示录（Love is 0） 　　
618 福尔摩斯的默示录（撒旦） 　　
619 福尔摩斯的默示录（Code break）　　
620 福尔摩斯的默示录（草场女王）　　
621 福尔摩斯的默示录（0 is Start） 工藤新一来到伦敦，并第四次恢复身体，并且第一次向毛利兰正面表白；同时工藤夫妇知道灰原哀是APTX4869的研发者。
651 幽灵旅馆的推理对决（前篇）　　
652 幽灵旅馆的推理对决（后篇）　　
653 侦探事务所笼城事件（勃发）　　
654 侦探事务所笼城事件（狙击）　　
655 侦探事务所笼城事件（解放）　　
656 柯南VS平次 东西侦探推理对决★ F/X 自称侦探的世良真纯登场，并转入帝丹高中；之后在柯南平次侦探对决中，茱蒂、卡迈尔在看到世良的照片后表示世良“很像某个人”，而詹姆斯则一眼看出世良是女孩子。
674 婚礼前夕（前篇）　　
675 婚礼前夕（后篇） 自称侦探的安室透登场，在事件解决完毕后自愿成为小五郎的弟子。
679 侦探们的夜想曲（事件）　　
680 侦探们的夜想曲（诱拐）　　
681 侦探们的夜想曲（推理）　　
682 侦探们的夜想曲（波本）
冲矢昴脱口而出的一句“不要露出那种表情”，似乎让灰原感到相当在意。
贝尔摩得给波本打了电话，同一时间冲矢、世良和安室正在接听电话，波本似乎就是这三人其中之一。
701 工藤优作未解决的事件（前篇）　　
702 工藤优作未解决的事件（后篇）冲矢昴举止可疑，虽然证实脖子上无异样，但却没有说话，并众人离开后左手拿出之前藏起的梳子。世良在房间中发现了女性线索，冲矢因此被怀疑真实身份，后根据柯南的叙述得知“女性线索”很可能为工藤有希子所留，最后世良含泪回望柯南和兰，说：“果然我是个坏孩子呢。”
710 逼近灰原秘密的黑影（前篇）　　
711 逼近灰原秘密的黑影（后篇） 　　世良问小兰阿笠博士的车子颜色，假装在群马县与柯南偶遇，并试图让柯南通过她的手机与灰原哀联络，而步美等人困在被凶手纵火的小木屋中，灰原为了让大家逃生而服下APTX4869解药，世良对光彦拍下的视频中的宫野志保非常惊讶，另外此段视频也被安室透、冲矢昴通过网络看到。
712 漆黑的特快列车（发车） 　
713 漆黑的特快列车（隧道） 　　
714 漆黑的特快列车（交叉） 　
715 漆黑的特快列车（终点） 黑衣组织通过宫野志保手上的“铃木特快号”神秘列车戒指票，知道其将乘坐神秘列车。于是贝尔摩德假扮成伤疤赤井潜入铃木特快号，并确认雪莉就在车上。贝尔摩德给灰原哀发去声明要取其性命的短信，灰原离开包厢并受到侵入其手机的冲矢昴“到我的领地来”的邀请。世良在列车上遇见了贝尔摩德假扮的赤井秀一，喊了他“秀哥”后被电晕，但被冲矢昴带回了世良的包厢。贝尔摩德扔掉了工藤有希子的变装工具，并引发排烟装置，安室透配合谎称车上发生火灾，引乘客逃离避难。柯南给有希子打电话，诱骗贝尔摩德未离开包厢，并在说穿怪盗基德身份后委托他假扮成宫野志保进入最后客车厢。安室透出现，对“宫野志保”说出自己的组织代号“波本”，以及之前的伤疤赤井是自己假扮，目的是为了调查赤井的生死，也因此确认了赤井的死亡。安室透将“宫野志保”逼入最后一节车厢，身后突然出现无疤赤井，向车厢连接处扔了一枚手榴弹，车厢脱离后贝尔摩德引爆了炸弹，怪盗基德乘滑翔翼逃离。列车停靠后贝尔摩德发现雪莉未死，但没有告诉组织其他成员。安室透对赤井之死产生怀疑，准备重新调查。冲矢昴露出与赤井秀一相同的眼神。
717 解谜的波本 B 安室透注意到柯南使用麻醉针的动作，对“沉睡的小五郎”产生兴趣。