寡核苷酸多态性数据库 database of SNP。
dbSNP数据库为广大研究者提供了丰富的SNPs信息,充分地利用dbSNP数据库中的资源将大幅度降低研究成本提高研究效率。
SNP-单核苷酸多态性(SNP):全称Single Nucleotide Polymorphisms,是指在基因组上单个核苷酸的变异,形成的遗传标记,其数量很多,多态性丰富。指在基因组上单个核苷酸的变异,包括置换、颠换、缺失和插入。从理论上来看每一个SNP 位点都可以有4 种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种,即转换和颠换,二者之比为2 :1。SNP 在CG序列上出现最为频繁,而且多是C转换为T ,原因是CG中的C 常为甲基化的,自发地脱氨后即成为胸腺嘧啶。一般而言,SNP 是指变异频率大于1 %的单核苷酸变异。在人类基因组中大概每1000 个碱基就有一个SNP ,人类基因组上的SNP 总量大概是3 ×10E6 个 。
dbSNP数据库为广大研究者提供了丰富的SNPs信息,充分地利用dbSNP数据库中的资源将大幅度降低研究成本提高研究效率。结合本实验室的研究工作,对鸡dbSNP数据库的检索和应用进行了一些探索。认为根据研究目的的不同,dbSNP数据库的检索和应用有必要同其它的数据库相结合。
SNPs(单核苷酸多态性)作为新一代遗传标记具有数量多、分布范围广、密度大等特点,已广泛应用于遗传学的研究中[1]。SNPs的检测一直是遗传学研究的一个热点,传统的方法有SSCP(单链构象多态)、DGGE(变性梯度凝胶电泳)、RFLP(限制性酶切片段多态)。后期发展起来的技术主要包括DHP