质粒用一种内切酶切会自连的，所以一般做克隆进来避免用单酶切。
如果没有办法，只能用单酶切，最好对质粒进行碱性磷酸酶处理，去磷，这样能够降低自连的比例，增加克隆成功的概率。
目的基因单酶切一般不会自连的。
当然会自连。如果有足够丰富的酶切位点，选择双酶切会好很多。但是以目前的技术手段，就算自连也很容易挑选克隆。
目的基因自连，转化宿主后宿主不能生长；载体自连，多数情况下可采用蓝白斑筛选，白色的是自连的，蓝色的是插入目的基因的。
通常用同种限制酶 可能自连 所以才检测
可以的用同种限制酶。…不会自连
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