①细胞质基质在有氧呼吸第一阶段和无氧呼吸时会产生ATP,①正确; ②线粒体在有氧呼吸第二阶段和第三阶段时会产生ATP,②正确; ③叶绿体在光合作用光反应时会产生ATP,但植物根毛细胞内不含叶绿体,③错误; ④核糖体为蛋白质的合成场所,不能产生ATP,④错误.则植物根毛细胞内能产生ATP的细胞结构有①②.故选:C.