1、利率不同:商贷较高(10年期2013年)6、55%。公积金4、5%。2、放款时间不同:商贷快,公积金慢。3、最高额度不同:商贷一般不限,公积金有限制,各地规定不一样,最高额度一般在40万元-80万元不等。4、贷款对象不同:商贷不限,公积金只能对缴存对象办理。5、贷款权限不同:商贷不限,公积金贷款局限于缴存所在地贷款或者政策允许条件下的异地贷款。