1、经营环境不同
跨境电子商务经营属于对外贸易经营环境。你可能需要懂多种语言，其中更重要的是外国文化。例。外国人喜欢什么样的产品?其次，你还需要考虑许多外国节日。外国人也会在节日期间购物。比如美国的“黑色星期五”和中国的“双11”类似，所以你需要了解和熟悉国外的环境和文化。这是跨境电子商务运营面临的首个挑战，你需要适应不同的运营环境。
2、关境的不同
国内电商的范围都是在国内进行交易的，跨境电商又分为跨境出口电商和跨境进口电商，进口电商很好理解就是把国外的商品卖到国内，出口电商呢就是把国内的产品卖到除外，不管是进口还是出口，只要是不同关境之间的交易，在交易的过程中都会产生一个报关和清关。在出口国的海关处进行报关，在目的国海关处进行清关。
3、交易主体不同
国内电商的交易主体一般在国内，国内企业对企业，国内企业对个人或者国内个人对个人。而跨境电子商务交易的主题则肯定是关境之间。
跨境电商的交易主体遍及全球，有着不同的消费习惯，文化心理，生活习俗等，这就要求跨境电商卖家对各国流量引入，各国推广营销，国外消费者行为，国际品牌建设等有更深入的了解，复杂性远远超出国内的电商。
4、适用规则不同
跨境电商比国内电商所需要适应的规则更多更细更复杂，首先是平台规则，跨境电商经营除了借助国内的平台，还需要在国外跨境电商平台上开展交易，各个平台均有不同的操作规则。
一、地域性的区别，国内电商使得很多相隔很远的地区或者国家无法进行双边贸易，或者进行贸易的成本较高，而跨境电商解决了这一问题。通过电子商务的推动，处于不同国家或者地区的商家以及消费者可以通过互联网，实现其交易成本的最小化，从而达成交易。
二、成本上的区别，对比传统外贸发展模式，跨境电商成本较为低廉，这时候就需要我们解决供应链问题。因为合理的供应链，可以使得企业大幅度节约成本。而国内电商贸易发展模式，出口商品一般都是在国内采购好，然后才运往国外进行销售。跨国电商可以根据销售数据，在国外合理的布局商品的仓库，直接配送，可以使得采购商购买意愿不会降低，同时可以使得企业大幅度降低时间成本。
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