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1、缴费周期：职工医保是按月缴费，新农保按年缴费。2、缴费金额：职工医保是按照参保人缴费基数核算月缴费额，所以个体间是有较大差异的；但新农保缴费金额是一样的。3、缴费主体：职工医保是个人和所在企业；新农保是个人和当地政府。4、报销比例：各地间报销比例有差异，但同一地间此二者报销比例也不相同。
