明代的南京城，即是今日为世人所熟知的江苏省南京市。1356年，朱元璋攻下元朝的南京城，他将南京城的名字由元朝的“集庆路”改为“应天府”，以此为根据地。1368年，朱元璋称帝，应天府也改名为南京，十一年后再度更名为“京师”。不过，永乐十九年（1421年），永乐帝将首都迁移至北京顺天府后，遂称应天府为南京，南京之名也就沿用至今。
明神宗时,南京叫南京。
已经从应天府改为南京了。
明代建国后，于1368年以应天府为南京，1378年定南京为京师。明成祖以北京为京师，恢复南京之名。直到清代初年，改应天府为江宁省。所以明神宗时，南京就叫做南京，也可称应天府。
明神宗时期，南京称为“金陵城”“应天城”
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