一般按医疗业务部门划分，如：HIS主要偏重门诊、住院经济管理方面的业务，包括的部门有门诊挂号、门诊医生站、门诊收费、门诊护士站、门诊药房、住院登记管理、住院医生站、出院结算、中心药房、药库等；LIS主要指检验科业务管理；PACS主要是放射科影像图片管理；EMR主要指住院临床病历信息管理，等等。
