医院始建于1951年10月，其前身是山东省军区第二陆军医院，1952年7月，移交山东省地方，改为山东省第五康复医院；1959年6月11日，医院移交济南市卫生局，改为济南市立第三医院；1972年更名为济南市第三人民医院。
