93年7月23日, 公牛取得三连冠后两个月, 乔丹的父亲詹姆斯·乔丹参加完一个朋友的葬礼, 他把车停靠在州际95号路边一个靠近Lumberton, North Carolina的空地上, 小睡了一会儿. 当地的两个犯人Daniel Green和Larry Matin Demery 杀了他并偷走了乔丹送给他父亲的凌志车. 这两个罪犯还用詹姆斯的手机打了几个电话, 并被迅速逮捕了. 8月3日, James的尸体在一个沼泽被发现. 直到5号才正式被确认. 因为精神上的巨大打击同时为了寻找新的挑战, 就在训练营的前一天, 乔丹震撼了整个篮球界, 他宣布他退役了. 两天后, 他宣布退役. 他的23号球衣也在公牛队退役. 经过长时间的思考, 乔丹再次回到聚光灯下时, 穿的是棒球服. 为了完成他父亲的心愿, 乔丹进入了棒球大联盟(Major League Baseball). 他为伯明翰男爵队(Birmingham Barons)--芝加哥白袜(Chicago White Sox)的下级会员--参加AA级南方联赛(Class AA Southern League)打了94年的棒球赛季. 他能胜任一个不出名的小角色, 但是他想进入大联盟的愿望看起来很渺茫. 在95赛季临近时, 棒球大联盟爆发劳资纠纷, 乔丹燃起回归NBA的火焰. 不久在NBA94-95赛季尚未结束时, 乔丹以简单一句"我回来了(I'm Back)"重新复出. 他回来了, 身披45号球衣, 希望再度带给公牛一个冠军头衔. 17场常规赛拿下13场, 场均26.9分, 乔丹交出这样一份成绩单 令人影响最深的莫过于复出后的第六场在纽约广场花园对抗尼克斯的比赛了. 这场比赛, 被称为"两个5(Double Nickel)"正式向世人宣告崭新的乔丹诞生了. 32岁的他没有了年轻时那骇人的弹跳, 他开始更多的使用后仰跳投和转身上篮. 在最后时刻, 双方还是平局, 只见他带球吸引对方注意后将球传给了篮底空挡下的Bill Wennington, 最终以113-111取得胜利。 他的教练, 菲尔·杰克逊赛后这样说到:"很少有球员能在纽约表现的很出色, 我见过很多球员因为这里的巨大压力而发挥失常. 但是乔丹整晚都把局势牢牢控制在自己的手中. 有时候就好像局势自己就往他手里钻似的。 季候赛上, 他场均拿下31.5分, 但是虽然乔丹站在球场上, 公牛队还是不足以跨过奥兰多魔术队这道关卡. 在东区半决赛上, 芝加哥公牛6场负于沙克·奥尼尔(Shaquille O'Neal)率领的魔术队。 乔丹次年率领着几乎和第一次夺冠时完全不同的队友再次取得冠军. 他重新穿回他的23号球衣,但是身边只有老伙计Pippen是过去那只三连冠队伍的一员. 公牛队加入了丹尼斯·罗德曼(Dennis Rodman), 一个有些古怪但蓝板和防守上的顶尖好手. 这只队伍度过来战功卓著的一个赛季, 取得了有史以来没有任何球队能取得得佳绩. 乔丹以30.4分在得分榜上排名第一, 公牛队常规赛创造了72胜的记录, 季候赛也是以总战绩15-3, 总决赛6场击败超音速而夺得桂冠, 痛苦的是, 乔丹是在父亲节那天重新拿到的总冠军.比赛结束后, 他紧抱着篮球坐在联合中心(Unit Center)(在他退役时公牛的主场由芝加哥体育馆变成联合中心), 失声痛哭. 那一刻, 哀伤的情绪感染了所有人。 在这一年的征途中, 乔丹拿下常规赛,全明星赛和总决赛三项MVP(98年乔丹又来了一次包圆), 之前也只有Willis Reed在1970年做到过(注: 沙克·奥尼尔在2000年也做了一次)。 虽然Karl Malone荣膺了96-97赛季的常规赛MVP(乔丹在97-98赛季又重新夺回了这个荣誉) 并且再一次率领公牛6战压过Malone的犹他爵士登上顶峰. 哪怕在关键的第5战时身患严重的胃感冒有着发烧和脱水的状况, 他也不允许自己的队伍轻易输掉, 那场比赛他拿下38分助公牛取胜, 最后在主场拿下了第6场的胜利. 第5次拿下总决赛MVP头衔. 公牛又来了个三连冠, 97-98赛季再次6场战胜了爵士队, 乔丹和他的队伍在第6战最后时刻还落后3分, 在突破得到宝贵2分之后. 他在后场从马龙手上抢下篮球, 冲向篮圈在还剩6.6秒时投出致胜的一球. 这个飞越Bryon Russel的进球的精彩镜头印刻在无数球迷的记忆中, 这场照片也永记史册. 99年, 由于劳资纠纷, 只剩下一个缩水的赛季, 乔丹也再次离开球场, 他说到"现在我已经不像过去那样具有动力让我继续当一个篮球运动员了". 尽管第二次退役后乔丹有整整三个赛季没有打球, 他可能依然是世界上最广为人知的运动员。 然而, 在2000年做为华盛顿奇才队股东和球队运营经理一职后, 由于对球队的表现的不满, 他又一次回到他所钟爱的运动中来了. 2001年9月25日, 他以老将底薪与奇才签了两年合约. 乔丹带来了他在公牛的老教练Doug Collins希望能把这只队伍拉出烂队的沼泽. 可惜虽然奇才获得了争夺季候赛门票的资格, 无奈两年都没有闯入季候赛. 但是乔丹还是留下了不少伟大的瞬间, 比02-03赛季刚过40岁的他拿下40分的高分. 2001年, 时任奇才球队主席的乔丹走出了他的办公室, 重新回到了篮球场. 由于年岁的增长, 他的球技已是大不如前. 尽管受到伤痛的折磨, 他还是每场拿下了几乎23分. 带着伤痛(尤其是膝伤), 他依然是球队重要的一员. 乔丹02-03赛季穿着特殊设计能减轻膝盖压力的球鞋, 健康的回到了场上, 这一次, 他场均拿下20分. 那一年, 他打了他最后一届全明星赛, 赛季结束后, 他第三次和球迷们说了再见. 01-02赛季初, 乔丹捐了1百万美元帮助那些911事件的受害者。 出于对乔丹的尊敬, 尽管他从没为佛罗里达的球队效力, 迈阿密热队在03年4月11号还是退休了他的23号球衣. 这是迈阿密热队15年队史中第一次退役球衣. 那件衣服半边是奇才蓝另一边是公牛红。 费城之战是乔丹生涯的最后一战, 03年4月16日, 在有限的上场时间里, 乔丹拿下15分但是没能帮助奇才最终获胜. 最后1:44秒, 乔丹投入他最后的两粒罚球球,全场热烈鼓掌长达3分钟 可惜无奈奇才还是没进季后赛. 04-05赛季, 没有乔丹的奇才杀出重围, 进军季后赛, 第一轮灭了公牛, 第二轮已横扫的结局被被热队踢出了球赛。
早期和兴盛时期在芝加哥公牛,末期去了华盛顿奇才。现任夏洛特山猫队股东之一