这个很难办哎，首先发票丢失要去国税打丢失证明，要处罚款200元一张，其次是发票都过了认证期了的话，不能开红字了，超麻烦的。先去国税打遗失证明交罚款，然后就是把发票复印件及证明寄给对方，因为发票过期了，对方单位不能抵扣税款，只能全额入账，税款部分你要查明原因发票到底是对方遗失的还是快递过程中或其他原因遗失的，再来追究责任该有哪方承担。。。
这只是个人意见，这种情况也没碰到过，过了认证期的发票红字肯定是开不了了的，，你还是问你们国税的专管员吧。。
没办法了，超过90天的发票不能认证抵扣也不能作废和开红字发票冲，只能去税务机关开个已报税证明单并用记帐联复印件做帐用，进项税计入成本中。至于进项税由谁负责你们自己协商了。
你把那两张发票的复印件盖上你的发票专用章寄给客户,让对方去税务局开发票丢失证明 ,你接到后开红票把这原先的冲掉 在重新给客户开然后寄给他们就好了
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