南开大学比较好。
一、学科评估
南开大学有14个学科进入A类，其中数学、化学、理论经济学、统计学、工商管理5个学科获评A;政治学、马克思主义理论、应用经济学、中国史、世界史、中国语言文学、物理学、生物学、环境科学与工程获评A-。
同济大学有12个学科进入A类，其中土木工程、环境科学与工程、管理科学与工程、城乡规划学获评A+，设计学获评A;数学、机械工程、建筑学、计算机科学与技术、交通运输工程、软件工程、风景园林学获评A-。
二、地理位置
南开大学位于天津南开区，地邻首都北京，毕业后可以前往北京发展。
同济大学位于上海，地处珠三角，考生以后的就业机会和就业前景都比较好，从地理位置来考虑，同济大学自然占有优势。
三、专业
同济大学土木、建筑等工科专业实力强大，相比较而言南开大学则是文史类、理科实力比较强大。
同济大学和南开大学差不多的。同济大学师资更好一点。
同济大学（Tongji University）简称“同济”，是中华人民共和国教育部直属，教育部与国家海洋局、上海市共建的全国重点大学；中央直管副部级建制高校，国家“世界一流大学建设高校”。
国家“211工程”和“985工程”建设高校；入选国家“珠峰计划”、“强基计划”、“2011计划”、“111计划”、卓越工程师教育培养计划、卓越法律人才教育培养计划、卓越医生教育培养计划、国家大学生创新性实验计划、国家建设高水平大学公派研究生项目。
院系调整：
从1949年开始，为配合新中国教育资源统筹布局，同济大学历经多次院系调整。
1949年9月，文学院和法学院并入复旦大学，后随复旦大学支援了华东政法学院（现华东政法大学）、上海财政经济学院（现上海财经大学）等校的建设。
1950年，为了支援湘、鄂、粤、桂、豫、赣六省（中南区）医疗卫生事业，医学院和附属同济医院全部迁往湖北武汉，与武汉大学医学院合并后改名中南同济医学院（现华中科技大学同济医学院）和武汉同济医院。
以上内容参考：百度百科——同济大学
无论从学风历史上讲还是从整体实力上讲，它们都不是一个档次的，当然是南开好了不过也得分系，总的来讲还是南开好。同济在上海，现在的家长什么的都对上海北京趋之若鹜，所以同济的分也不是很低，跟城市有关。
无论从学风历史上讲还是从整体实力上讲，它们都不是一个档次的，当然是南开好了不过也得分系，总的来讲还是南开好。同济在上海，现在的家长什么的都对上海北京趋之若鹜，所以同济的分也不是很低，跟城市有关
1.如果你想找工作的话，可以拿东师和南开谈一谈。东师所在的地方工作绝对是不错的。但是你想啊，等你毕业了，你的学校不是你所在地域的一流学校，你必须跟复旦同济交大之类的名校竞争，这也决定你无法拿到最好的offer。当然你卓越的话，咱们就不说了，咱只说普遍的情况。当然，咱不能说南开的就业不好，也是不错的。特别是物理，保研率还是蛮高的。我认识的有去中科院的，有去中科院下辖的在上海的研究所的，有出国的，当然也有去南开中学当物理老师的（这个也很好。）
2.如果你想搞科研或者将来出国的话，南开是你不二选择！首先，南开的学术氛围相当的好。虽然我不是物理的，但是我可以跟你说，我们学校的人在一流学校里面相当好学啊。如果你想出国，哇，那更应该选南开了。一所名校在你考虑出国时候可以给你的是其他非名校给不了的。他的出国考英语的氛围，他的老师国外资源，他的国外知名度。
3南开是个好学校，你要是进去了，好好把握机会。
4你可以上上南开和华师的官网。查找相关资料。这个是你自己必须做的。了解这两个学校的历史，现状。你才会有个直面的感受。我也可以替你找到物理学院的资料，但是你就无法想去官网那样，自己亲身感受了。
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