A、层析液用于分离色素，A错误；B、石英砂（二氧化硅）的作用是破坏细胞结构，进行充分研磨，B正确；C、碳酸钙的作用是放在色素被破坏，C错误；D、用棉花塞堵住色素提取液的试管口，用培养皿盖住层析液的烧杯口的作用是防止有机溶剂的挥发，D错误．故选：B．
