不会少了,等你辞工了可以全部拿回来的,不过建议你先辞工把钱全部拿了,要是你还想在那里工作还可以再进去,这样不会为赔偿款的原因烦恼,也省了到时公司不给钱申请劳动仲裁的麻烦
工伤赔偿是一次性的,应该与单位协商,妥协解决为好。