A、①DNA复制和⑤逆转录碱基互补配对的区别在于⑤逆转录有U-A配对，A错误；B、③转录和⑤逆转录碱基互补配对的区别在于⑤逆转录有A-T配对，B错误；C、②RNA复制和③转录的碱基互补配对的区别在于③转录有T-A配对，C错误；D、②RNA复制和④翻译的碱基互补配对的方式都是A-U、C-G、G-C、U-A，D正确．故选：D．
