根据你的描述,我认为是软腐病,软腐病病菌主要靠雨水、昆虫、灌溉传播,整枝过晚、露水未干整枝是软腐病的主要传播途径,发病期间可以喷施可杀得、络氨铜、农用链霉素防治。
你说的是整个根部还是地表处。是因为土地板结、大水漫灌长时间渗不了、气温突然升高等原因造成的, 增施有机肥,密度小一点,喷一些杀菌药等都可以缓解。