公司没有资格吊销你的证件，但是公司严格起来可以根据合同追究你的相关责任，这个就看你的公司怎么样了？有的公司会不了了之，因为现在船员闲置在家的太多了，特别是普通船员（就是你说的水手和技工）。海员证是根据你的相关从业证件（包括大证，也就是三副三管轮证，也包括四小证）去办理的证件，海员证丢失或者到期时可以补办的，去学三副，对你没有什么影响，唯一影响就是你公司会不会因为合同找你付违约金（可能包括你的培训费，当然如果你没有在公司培训的话就没有了，违约金也不会很多的）。
另外，去学习三副时，最好报些比较好学校，不要再去找什么中介了，在和公司签合同时一定要签“自然年”，海龄不合算的，一直不派你上船，你就一直不够了，懂吧
公司只能扣住你的海员证，就是他不把你的海员证注销你就没法再办海员证，其他的都和公司没关系。国内航线是不用海员证的，有四小证就行。
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