从严格意义来讲，两者的区别主要在于：
环境科学属于理科，环境工程属于工科。
环境科学从课程设置上来看，主要偏向于环境污染的防止技术，主要以化学、生物、分析检测等为基础。环境工程主要偏向于环境污染治理的工程技术，主要以物理、工程设计施工技术等为基础。
从研究方向来看，环境科学偏向科学研究领域，环境工程偏向工程应用领域。
但是从目前的学校课程设置来看，很多学校划分的不是很严谨，两个学科的知识都相互交叉。
从就业的角度来看，很多企业划分的也不是很认真，两个专业都差不多。
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