初始化金蝶系统时可以把科目余额都写成零,然后做第一张凭证：借：银行存款⼀库存现金 贷：实收资本，可以吗

你从初始建账 也得把公司开始月份的账务 给补上，就是说 若你公司去年10月开业的话，你2012年用金蝶做账的 初始数据录入日期也得是 2011年10月份的 ，
至少 有这 验资 入资 的基本账务 应根据 银行 的实际 票据 做分录
如：（在验资期间没有产生利息的）
1、投资款 借 银行存款----验资户 50万 贷 实收资本 50万
2、投资款转入基本户 借 银行存款 ----基本户 50万 贷 银行存款 ---验资户 50万

3、再做点费用 及 工资 ，有交税的情况下 也需 要做账的 。
账目乱的话 后面2个月随便做点费用 及工资 即可。

因为 一个公司 刚开始的 验资入资 账务必须 要有的 ，这才为一个正常 状态。
购得固定资产 找一个月就近 做上就行。

建议你选择后一种吧，因为厂子肯定有余额。不过还是征求下老板的意见，看老板的意思。

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‘之前账务一直很混乱’，是很混乱还是之前没有建账？有没有报过税？