出入境检验检疫局负责商品报检,海关负责报关,不是所有商品都要报检但都要报关,需要商检的货物先报检后报关,两个机构隶属不同,检疫局隶属质检总署,海关隶属海关总署
出入境检验检疫局负责进出境的物品是否有病毒和病菌几是否符合相关标准;海关主要负责进出口有无违章,走私,收税.