刚上班两天受了工伤赔偿会受影响吗?

先明确一点，是不是工伤你说的不算，我说的不算，得由法律说了算。
你有认定工伤决定书了吗？有的话，申请做劳动能力鉴定，根据级别，赔偿金额是法定的，不会受到任何影响。
如果没有认定工伤决定书，那先行申请认定工伤，认定为工伤以后再申请劳动能力鉴定。如果鉴定到伤残等级的话，那具体赔多少钱就有法律依据了。如果你觉得赔偿受到影响，到时候你只要自己提起劳动仲裁就行，肯定会给你一个满意的答复。
而且根据现行法律规定，劳动者自用工之日起即与用人单位存在劳动关系，而且工伤认定过程中实行的是无过错原则，与你上班时间的长短没什么联系的。
只不过就你问的这个问题而言，如果用人单位未为你缴纳工伤保险，尚未签定劳动合同的话，如果公司不配合，那你在申请认定工伤时先得申请确认劳动关系而已。
个人观点，供参考。

没什么影响，公司不配合申报工伤的话一般会比较麻烦

不会受影响

1.只要与用人单位存在劳动关系且受伤情况符合《工伤保险条例》第十四、十五条之规定（且不存在第十六条规定之情形）的，无论工作时间长短，是否签订劳动合同缴纳社会保险，都应认定为工伤并按工伤待遇获得赔偿。
2.工伤的赔偿标准是依据《工伤保险条例》以及各地市出台贯彻实施《工伤保险条例》实施办法的相关规定确定的。
3.根据《工伤保险条例》的相关规定，如受伤被认定为工伤，可享受如下工伤待遇：
（1）医药费由用人单位全额垫付；
（2）停工留薪期内（工伤治疗、康复期间）工资按原待遇发放；
（3）停工留薪期内需要护理的由单位负责；
（4）住院期间伙食补助费按由工伤职工所在地标准发放；
（5）如经劳动能力鉴定为1-10级伤残的，还可以享受伤残津贴（1-6级伤残），一次性伤残补助金，一次性工伤医疗补助金（5-10级伤残解除合同后领取）和一次性伤残就业补助金（5-10级伤残解除合同后领取）等待遇。