信长烧毁比叡山有以下三大原因
比叡山多次为与信长作战的政敌提供庇护，甚至协助这些人战败后东山再起。
当时有不少日本僧人品行不端，对比刚传入日本的西洋宗教看似知书达理使信长对僧人产生偏见。
给所有与信长为敌的武家、公家、法家一个警示，只要继续保持敌对态度，没有信长不敢杀的人。
一些人认为这是信长残暴的证明。参看火烧比叡山的年份对比正是松永久秀初次背叛。当时想要谋反的人数不胜数，荒木村重、明智光秀就是最好的证明，信长需要做一件足以震慑整个日本的事。随后重新接纳松永这个反复小人足以看出信长并非嗜杀成性，也能印证这事正是打一巴掌给个枣的老手段。
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