1代和2代是接着的，当时1做了一半，后来2改了人名接着做，主角是何然（天之痕里的然翁）、古月（天之痕里的古月仙人）和江如红，何然给氐人族设置了青春不老结界，然后和古月一起去了仙人岛隐居。
然后就是3外天之痕，主角们向仙人求助时，仙人就是古月和然翁。古月提到神器剑、钟和塔都曾化为人形，但是因某件事，剑和塔失去力量变回了原形，只有钟还是人形。
【主篇故事顺序】。
轩辕剑壹——轩辕剑贰——穹之扉（商代）——轩辕剑陆（商末周初）——苍之涛（春秋）——枫之舞（战国）——轩辕剑肆（秦代）——轩辕剑柒（西汉）——云之遥（三国·曹魏）——汉之云（三国·蜀汉）——轩辕剑伍——天之痕（隋代）——轩辕剑叁（安史之乱前后的欧洲、阿拉伯地区、唐帝国）。
扩展资料
轩辕剑的主要剧情：
陈靖仇是陈国最后一位皇子，背负着复国之命的他，十八年来没干过一件像样的事。一直在靖仇身边苦心教导他的陈国遗臣陈辅，听闻若要复国成功，最快的方法就是集合上古五大神器。
陈靖仇在陈辅的督促下，身不由己的开始了寻找神器的旅程。但复国之路刚开始就遭遇波折，他遇最强的对手，北周后裔宇文拓，同样一位身负国仇家恨的皇子，两人都有着复国的使命，手段与性格却截然不同。
1代和2代是接着的，据说是当时1做了一半，后来2改了人名接着做的，主角是何然（天之痕里的然翁）、古月（天之痕里的古月仙人）和江如红，具体情节我没玩，不是很清楚，反正何然给氐人族设置了青春不老结界，然后和古月一起去了仙人岛隐居。
然后就是3外天之痕，主角们向仙人求助时，仙人就是古月和然翁。古月提到神器剑、钟和塔都曾化为人形，但是因某件事，剑和塔失去力量变回了原形，只有钟还是人形，但鲜少有人知道她在哪。
此外，古月在云之遥（5外）的兰茵篇里也出现过，救下兰茵，借给她盘古斧。
天之痕的最后，阿拓带着灵魂正在净化宁珂和炼妖壶去了西方。150年后，赛特（3代）从西方来东方求学，身上就有炼妖壶，而且他和阿拓一样有穿越时空的能力（赛特和阿拓的关系没有明确交代，有说转世有说后代）。妮可（宁珂的转世）也“奉命”跟着他。后来同伴里的李靖，在天之痕里也出现过，是张烈的义弟。
2外枫之舞的主角辅子彻、文锦和机关人，在黑龙（4代）里是主要配角，文锦和疾鹏活了200年，是主角水镜的“领导”，大寨的夫人。水镜和姬良最后应该是成亲了，在苍之涛（4外）和云之遥兰茵篇里都提到过的留侯夫人应该就是她。她、疾鹏和云中界主人（一说是犀衍一说是姬良）分别帮助苍之涛的各个主要人物穿越时空回到1000年前。
一剑（5代）里一共出了3个神器转世——轩辕剑皇甫暮云、昊天塔陆承轩和东皇钟夏柔，这就是之前提过的古月说这3个曾转世为人。一剑的2个结局里，轩辕剑都回复了原形，普通结局塔也变回了原形，倒是隐藏结局没说他是否变回去了（你可以理解为版本间的矛盾，也可以认为陆承轩接续心脉也活不长，最终战后就死掉了，我觉得诸葛亮和徐庶都这么死了，他也这么死很正常）
一剑里的皇甫暮云，实际是双胞胎兄弟的合体。汉之云（5外）和云之遥（5外）分别以三国时期蜀和魏的视角讲述了兄弟二人的经历（皇甫朝云和徐暮云），是如何得知天女的事情，最后2人为什么会合为一体，然后去了山海界。在汉之云里也以支线的形式出现了尚在人间界的陆承轩的一小段经历，结尾时夏柔也露了一面（送了轩辕剑回到耶亚希身边）。
云之遥把暮云得知天女故事的经过讲的远比汉之云清楚，汉之云对天女的交代就是朝云继承了暮云的记忆后，决定为暮云干这件事，但是暮云怎么知道的天女的故事却一字未提。
一剑基本是接着汉之云/云之遥里兄弟2人去了山海界之后的事情开始讲的，不过主角变成了陆承轩，暮云变配角了。但是汉之云和云之遥有个大矛盾，就是到底去山海界的皇甫暮云是谁，一个说的是朝云，一个说的是暮云。
你说的主角是坏的，我玩了其中7部，没觉得有这么一部，我觉得你说的可能是4外苍之涛里的桓远之。因为本以为他已经不打算改写历史了，但在结局时他还是改写了历史，并且误杀了女主角车芸。但是尽管如此，我并不认为他是坏的，而且最后也谈不上大悟。他只不过是立场和其他2个主角（车芸和嬴诗）不同，所以选择不同。在一开始他虽然怀着自己的目的帮助车芸和嬴诗，但是他对车芸的关心是真心的，因为车芸救了他的命。但是在民族问题上，他不能忍受原本历史下自己的民族败给了异族，所以就改写了历史。
其实互相之间没什么关系，只有某代和某代的外传有关系，基本外传都发生在这一代故事之前，但关系都不大，剧情都是独立的
4的外传的男主人公是坏的（也不能说坏，只是为了自己目的不择手段），最后把女一号害死了才大悟
1代和2代是接着的，据说是当时1做了一半，后来2改了人名接着做的，主角是何然（天之痕里的然翁）、古月（天之痕里的古月仙人）和江如红，具体情节我没玩，不是很清楚，反正何然给氐人族设置了青春不老结界，然后和古月一起去了仙人岛隐居。
然后就是3外天之痕，主角们向仙人求助时，仙人就是古月和然翁。古月提到神器剑、钟和塔都曾化为人形，但是因某件事，剑和塔失去力量变回了原形，只有钟还是人形，但鲜少有人知道她在哪。
此外，古月在云之遥（5外）的兰茵篇里也出现过，救下兰茵，借给她盘古斧。
天之痕的最后，阿拓带着灵魂正在净化宁珂和炼妖壶去了西方。150年后，赛特（3代）从西方来东方求学，身上就有炼妖壶，而且他和阿拓一样有穿越时空的能力（赛特和阿拓的关系没有明确交代，有说转世有说后代）。妮可（宁珂的转世）也“奉命”跟着他。后来同伴里的李靖，在天之痕里也出现过，是张烈的义弟。
2外枫之舞的主角辅子彻、文锦和机关人，在黑龙（4代）里是主要配角，文锦和疾鹏活了200年，是主角水镜的“领导”，大寨的夫人。水镜和姬良最后应该是成亲了，在苍之涛（4外）和云之遥兰茵篇里都提到过的留侯夫人应该就是她。她、疾鹏和云中界主人（一说是犀衍一说是姬良）分别帮助苍之涛的各个主要人物穿越时空回到1000年前。
一剑（5代）里一共出了3个神器转世——轩辕剑皇甫暮云、昊天塔陆承轩和东皇钟夏柔，这就是之前提过的古月说这3个曾转世为人。一剑的2个结局里，轩辕剑都回复了原形，普通结局塔也变回了原形，倒是隐藏结局没说他是否变回去了（你可以理解为版本间的矛盾，也可以认为陆承轩接续心脉也活不长，最终战后就死掉了，我觉得诸葛亮和徐庶都这么死了，他也这么死很正常）
一剑里的皇甫暮云，实际是双胞胎兄弟的合体。汉之云（5外）和云之遥（5外）分别以三国时期蜀和魏的视角讲述了兄弟二人的经历（皇甫朝云和徐暮云），是如何得知天女的事情，最后2人为什么会合为一体，然后去了山海界。在汉之云里也以支线的形式出现了尚在人间界的陆承轩的一小段经历，结尾时夏柔也露了一面（送了轩辕剑回到耶亚希身边）。
云之遥把暮云得知天女故事的经过讲的远比汉之云清楚，汉之云对天女的交代就是朝云继承了暮云的记忆后，决定为暮云干这件事，但是暮云怎么知道的天女的故事却一字未提。
一剑基本是接着汉之云/云之遥里兄弟2人去了山海界之后的事情开始讲的，不过主角变成了陆承轩，暮云变配角了。但是汉之云和云之遥有个大矛盾，就是到底去山海界的皇甫暮云是谁，一个说的是朝云，一个说的是暮云。
你说的主角是坏的，我玩了其中7部，没觉得有这么一部，我觉得你说的可能是4外苍之涛里的桓远之。因为本以为他已经不打算改写历史了，但在结局时他还是改写了历史，并且误杀了女主角车芸。但是尽管如此，我并不认为他是坏的，而且最后也谈不上大悟。他只不过是立场和其他2个主角（车芸和嬴诗）不同，所以选择不同。在一开始他虽然怀着自己的目的帮助车芸和嬴诗，但是他对车芸的关心是真心的，因为车芸救了他的命。但是在民族问题上，他不能忍受原本历史下自己的民族败给了异族，所以就改写了历史。
如果是复杂版，就看楼上，如果简略版，如下：
1代完全是实验之作，在剧情上没有很大的重要性，现在只有DOS版。【正版差不多绝了】
2代故事开始趋于丰满，以水墨风为主要色彩，与后作4代黑龙舞兮云飞扬有很大关联。【此代包含枫之舞和主传】
3代是成名之作，不过故事开始是在西洋开始，主角赛特为中德混血，【不喜欢西洋的可以不玩这一代】或许这是楼主所说的。重点是外传天之痕，故事比较完美，而且有多个结局。这两部作品与可以算上同人作品的《轩辕伏魔录》与5代云之遥有所关联。
4代主传黑龙舞兮云飞扬，在当时看来没有很大的影响，外传苍之涛，就是楼主说得主角其实是坏的，【有点偏颇】其实桓远之，只是为立场所奋斗【尽管我都认为最后实在太不像话了】。这代真实的主角是车芸【loli控可入】。很心碎。
5代一剑凌云山海情，官方民间都不得好评，比四代主传还要失败，总体来说，可以算作它的外传汉之云，云之遥的补完。在轩辕剑游戏评区中，汉之云，云之遥外传排名不太高，但在整个游戏圈里，还是不错的。汉之云结局烂掉了，可以在民间找横艾结局，相对来说，更让人容易接受。云之遥重点在番外篇兰茵篇。【主篇风格雷同于汉之云，不过充满（哗……）】
以时间为序大概是这样：天之痕背景——一剑凌云背景【上古时代】——一代、二代、枫之舞【未知年代】——苍之涛【故事发生】【春秋时期】——黑龙舞兮云飞扬【战国时期】——云之遥【三国初年】——兰茵篇、汉之云、暮云篇、朝云篇【诸葛病亡】——天之痕【隋朝】——云和山的彼端【唐初时期】——轩辕伏魔录【大约宋朝】
木有啊……轩辕剑系列很正性的
关系太复杂了，说不清，只能说同数字的本传和外传关系比较大，代与代之间除了十大神器世界观一样，个别人物有联系基本没关系，大概就类似仙剑4和仙剑3的关系
12里的主角在3代外传天之痕和5外云之遥里打酱油
2外枫之舞里有配角是4代的反派，主角在4代里当酱油
3外天之痕里的某男配是3代男主的祖父，3代男主女友前世喜欢那个男配
4外苍之涛的某主角是在4代女主的帮助下穿越到春秋的
5代大反派是5外云之遥的男主，5外汉之云和5外云之遥故事关系是最紧密的，两代男主是亲生兄弟，只是一个是三国里蜀势力的，一个是魏势力的
比较独立的是轩辕伏魔录，除了一把轩辕剑其它剧情跟各代关系都不大
时间轴顺序是1（可能在夏朝左右）-2（接1代）-4外苍之涛（春秋）-2外枫之舞（战国）-4代黑龙舞兮云飞扬（秦初）-5外云之遥（三国）-5外汉之云（三国）-5一剑凌云山海情（汉之云之后不久）-3外天之痕（隋）-3云和山的彼端（唐）-轩辕伏魔录（年代未知）
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