基督教各派一般有以下三种组织形式：
主教制：
跟罗马天主教一样，每个座堂牧师负责一个牧省，每个牧区主任牧师负责一个牧区，旗下有零个至多个助理牧师作为助手。牧区内的其它教堂，会按由一个助理牧师负责多个教堂的方式负责。
长老制：
没有固定的负责牧师，每个教堂由多个长老负责，教会跟牧师间属于聘用关系。
公理制（最常见的）：
每个教堂之间互相独立，各自有一个主任牧师负责（总经理）。
可能有或者没有几个其它的牧师在他之下分担工作（副总经理）。重大事务要召开会众大会决定（股东大会）。另外有条件的情况下，有一些执事负责日常行政工作（部门经理）。全体牧师和执事开会决定一般事务（董事会）。
一个教堂的牧师数量可能因教堂的大小和教派而异。一般来说，一个教堂通常有一位主任牧师，但也可能有多个牧师。主任牧师是教会的负责人和管理者，通常负责协调和指导其他牧师的工作。
负责、管理教会的牧师通常被称为主任牧师。然而，具体头衔可能因教派而异。在某些教派中，其他牧师也可能担任领导和管理职务。
一般基督教堂最少有一位牧师，有的牧师牧养超过一间教堂，也是这些教会的负责人，有些可能有还没有按立牧师的传道同工，分担管理这些教堂的事工。
基督教各个教会的组织形式不一样，因所属的教派而异。
天主教和基督教也不同的，但更加统一和严格。
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