A、通过杂交将优良性状集中在一起，然后可通过不断自交选育稳定遗传的新品种，该育种方法为杂交育种，A正确；B、在哺乳动物杂交育种获得F1代后，让F1代雌雄相互交配获得F2代，F2代可通过测交获得纯合子，B正确；C、用植物的营养器官来繁殖过程属于无性繁殖，遗传物质不会发生改变，故只要出现所需要性状即可留种，C正确；D、基因工程育种的原理是基因重组，D错误．故选：D．
