分子式是对于那些构成物质的微粒是分子的物质而言的。如CO2，H2O,CH3COOH，但是有些物质如氯化钠不能以分子形式存在（由离子构成），虽然它也有化学式NaCl,但是无论固液气态的氯化钠中都不可能存在“由一个氯原子和一个钠原子构成的氯化钠分子”。因此分子式一定是化学式，化学式不一定是分子式。结构式主要应用于有机化学和结构化学，是用元素符号和短线组成的示意图，能直观表示物质的内在结构。要注意的是，分子构成的物质，其结构式就是一个分子的结构（如H2O）。由离子构成的物质，结构式是它的化学式对应数量的离子的结构，比如Na2CO3（如图）。
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