共同配送中的每一个企业在现实的经济运行中都是“理性的”经济人，都遵循着利润最大化的原则。因而，大部分加盟共同配送的企业通常实行一种松散的战略联盟或组成合伙制或股份制企业的形式，各加盟共同配送的企业按投入资源的多少索取剩余。建立公平的利益分配机制，明确物流成本在各企业之间如何公平的分配，保证共同配送所实现的利益在各参与企业间合理、公平的分配，做到利益的均衡。
