原则按规划面积，可很多农村自建房都有一定的辅助用房，这些房屋也会给予一定补偿，各地具体规定不一样，最好和上门拆迁人员协商。而且辅助用房也要分净高可超过标准，结构咋样，补偿是不一样的，到时自己注意点。土地使用证上的面积，指的是你规划审批的房屋面积所占的土地大小。
