芷江下辖5个建制镇:芷江镇、公坪镇、罗旧镇、新店坪镇、碧涌镇;23个乡:牛轱坪乡、艾头坪乡、岩桥乡、水宽乡、木叶溪乡、麻缨塘乡、竹铺坪乡、土桥乡、杨公庙乡、大树坳乡、上坪乡、大洪山乡、梨溪口乡、洞下场乡、罗岩乡、大龙乡、板山乡、冷水溪乡、禾梨坳乡、楠木坪乡、萝卜田乡、晓坪乡、五郎溪乡。 芷江镇 辖:北街、东街、南街、前街、和平路、凯旋路、黄甲街7个居委会;三里坪、七里桥、大垅坪、东门口、柳树坪、窑湾塘、曲溪垅、十万坪、桃花溪、社塘坪、合心、下菜园、小溪、洛家井、邓家坪、中洋溪16个村委会。 罗旧镇 辖:居委会;罗旧、巴洲、庄上、白石坡、枞树坪、跑田坪、曹家坪、浮莲塘、火麻坪、石马田、竹溪11个村委会。 新店坪镇 辖:新店坪镇居委;田家坪、沈家坪、黄双坪、宝龙山、长田溪、白马铺、陈家坳、一里街、水上、新田、白旗冲、杉木坳、荷叶塘、岩禾塘、牛坪、船板溪、桐木元、莫家溪18个村委会。 碧涌镇 辖:碧涌镇居委会;哨田、龙山、金坳、七甲坪、大坳、大冲、两口田、竹溪冲、马塘、龙洋、长田、碧河、碧涌、古竹14个村委会。 公坪镇 辖:通溪、高庄、桐树溪、瓦溪铺、顺溪铺、銮塘、公坪、长泥坪、孙家冲9个村委会。 牛牯坪乡 辖:肖家湾、温水垅、牛牯坪、千丘田、界牌、丁家坪、青叶树、茶林坪、沈家溪9个村委会。 艾头坪乡 辖:陈家垅、两头田、汤家湾、塘家桥、垅口、艾头坪、胡家头、杨家8个村委会。 岩桥乡 辖:槐花园、结连、台板丘、板桥、牛形、岩桥、倒塘湾、四方园、小河口、水路田、石板溪、桃水、栗木桥、三渡溪、郭家界、黄梨坳、巽公坡17个村委会。 水宽乡 辖:阳和田、泥溪垅、地头坪、拾担、水宽、干塘坪、柘莲、电冲8个村委会。 木叶溪乡 辖:小渔溪、地婆溪、枫木坪、木叶溪、黄土田、恶滩、千公牛、细米溪、茶坪、芷溪、多一塘11个村委会。 五郎溪乡 辖:五郎溪、牛皮寨、金厂坪3个村委会。 麻缨塘乡 辖:王公坡、桃溪、台上、麻缨塘、白溪坪、学坪、沙坪、羊楼坡、蕨菜溪、黄潭桥、沙溪、周坪、桥边、高冲14个村委会。 竹坪铺乡 辖:蜈蚣坡、竹坪铺、五里牌、畅风坳、蚂蝗塘、炉坪、傍竹溪、苗溪、沙湾、双吉冲10个村委会。 土桥乡 辖:土桥、洞下、岩田冲、分水坳、岔溪、哨路口、向家庄、冷水铺、两户、肖家田、草鞋坳、富家团、麦元13个村委会。 上坪乡 辖:三里桥、新华、上坪、对伙铺、长征、仲黄坪、普溪、马路坡、到湾、大竹园、把关口、桐木垅12个村委会。 大树坳乡 辖:凉水井、柑子坪、大思乐、黄双溪、小思乐、大树坳、新庄、石竹坪、牛屎田、岩嘴、扎牛坪、竹坡12个村委会。 大洪山乡 辖:皇后滩、天星塘、报木溪、团木溪、大洪山、青山口、罩子溪、茨滩坡、白水滩9个村委会。 杨公庙乡 辖:杨公庙、盐井、马田、浪圭山、云寨、红光、黄家浪、桃花坪、洪溪、蟠龙寨、大兴田11个村委会。 梨溪口乡 辖:下神祝、白土田、兰地、梨溪口、龙井冲、大冲口、白栗湾、金龙、戥溪、新田界、苗田界、龙降、龙排冲13个村委会。 洞下场乡 辖:瓮溶溪、楠木冲、洞下场、碑冲、古垅、尧坪、红旗、天堂坪、石桥、岩板田10个村委会。 罗岩乡 辖:蒜水、汪碧山、田坪、深坑溪、龙神、中心、步路田、罗岩8个村委会。 板山乡 辖:老鼠田、新屋、客仁棚、大山、苗田、桃子楼6个村委会。 大龙乡 辖:茂山、下寨、茶溪、白岩洞、井水冲、石榴溪、小塘溪7个村委会。 禾梨坳乡 辖:山下冲、高塘坡、古冲、大沙界、严家屋场、学堂坪、杨家桥、禾梨坳8个村委会。 冷水溪乡 辖:桐油坪、社山坪、瓮致溪、冷水溪、三门坡、瓮当溪、潘家田、陡山、王家庄、龙孔坪、向家元、大军田12个村委会。 楠木坪乡 辖:黄塔塘、秧田冲、古坡界、古坡冲、楠木坪、桂竹元、大坪头、曹家田、岩山背、桂竹冲、大禾冲、瓮塘、沅冲13个村委会。 晓坪乡 辖:晓坪、青竹溪、凉山坡、兰水、小冲、岩坳、岩贝、长塘、大水田、枇杷垠10个村委会。 萝卜田乡 辖:萝卜田、木田冲、半冲、早子山、马坡、冬瓜坡、新店、兴无、沙田坡9个村委会。 2015年,根据芷江县乡镇区划调整方案,调整后下辖9乡9镇,芷江侗族自治县共减少10个乡级建制,现辖牛牯坪、大树坳、禾梨坳、冷水溪、洞下场、晓坪、罗卜田、梨溪口、水宽9个乡,芷江、新店坪、碧涌、土桥、三道坑、楠木坪、岩桥、公坪、罗旧9个镇,总面积2099平方千米,总人口38.26万人,县人民政府驻地不变(芷江镇)。