A、线粒体基质进行有氧呼吸的第二阶段,产生了二氧化碳,细胞质基质进行细胞呼吸的第一阶段,产物是丙酮酸,叶绿体基质是暗反应的场所,产物是有机物(葡萄糖),A正确;B、丙酮酸产生的场所是细胞质基质,葡萄糖产生的场所是叶绿体基质,二氧化碳产生的场所是线粒体基质,B错误;C、由B分析可知,C错误;D、由B分析可知,D错误.故选:A.