甲胎蛋白AFP是原发性肝癌的高特异性和高灵敏度的肿瘤标志物。甲胎蛋白升高偏高意义 第一，在成人，大约80%的肝癌患者血清中出现甲胎蛋白升高，在生殖细胞肿瘤出现甲胎蛋白阳性率为50%。第二，孕妇的甲胎蛋白偏高可能意味着胎儿有缺陷。第三，甲胎蛋白偏高也可能是肝损伤、充血性肝肿大、共济失调、毛细血管扩张症、先天性酪氨酸病、孕妇（3~6个月）、睾丸或卵巢胚胎性肿瘤（如精原细胞瘤、恶性畸胎瘤、卵巢癌等）引起的。
甲胎蛋白的确是诊断肝癌的一项重要指标，但并非只要出现甲胎蛋白阳性，就可确诊为肝癌。
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