以天山为界，南、北疆差异明显。北疆为温带大陆性乾旱半干旱气候，南疆属暖温带大陆性干旱气候。北疆年均气温-4～9℃，全年降水量150～200毫米以上，全年无霜期140～185天；南疆年均气温7～14℃，全年降水量25～100毫米，全年无霜期180～220天。 四季分明，是北疆的一大特点。
