该中心共开通了6条公交线路：49路（福田枢纽—大学城南门）、64路（福田枢纽—布心山湖居）、202路（福田枢纽—航母世界）、210路（福田枢纽—月亮湾花园）、213路（福田枢纽—布吉检查站）228路（福田枢纽—火车站西广场）。预计2008年三月底前将开通跨特区的公交线路，年底前公交线路将增至20条以上。共开通了5条往广州方向的长途班线。原福田汽车站的客运班线将尽快分期分批调入，其他汽车站也将有部分线路调入。
