A、有丝分裂前期和减数第一次分裂前期中均有纺锤体形成，A错误；B、有丝分裂间期和减数第一次分裂间期中均有染色体复制，B错误；C、非同源染色体上的非等位基因自由组合仅发生在减数分裂中，C正确；D、有丝分裂后期和减数第二次分裂后期均匀着丝点分裂，姐妹染色单体分开，D错误．故选：C．
