A、叶的生长周期长，受环境的影响比较大，不适合当作分类的主要依据，A错误．
B、被子植物都适合生活在陆地上，因此生活环境不能是分类的主要依据．B错误．
C、根、叶、茎等营养器官在植物一生中出现得早，生存的时间比较长，受环境的影响比较大，形态结构不稳定，不适合当作分类的主要依据．C错误．
D、花、果实和种子等生殖器官比根、茎、叶等营养器官在植物一生中出现得晚，生存的时间比较短，受环境的影响比较小，形态结构也比较稳定，是被子植物分类的主要依据．D正确．
故选：D
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