尿液细菌培养除了上述普通的方法外，还有几种特殊的培养方法。
（1）高渗培养。长期使用抗生素、溶菌酶或体内补体作用等因素，常使细菌的细胞壁损伤、缺失、变异为L-型菌，需要在高渗培养基中进行培养。培养基含有15%蔗糖或5%氯化钠时细菌才能繁殖。
见于肾盂肾炎、菌血症患者恢复期或复发期。
（2）结核杆菌。培养培养方法是留清晨尿，以每分钟3000转离心，在沉渣中加入4%硫酸或2%氢氧化钠，20分钟后去除杂菌，中和后接种于罗氏培养基中，4～8周报告结果。
（3）真菌培养。患者若长期使用广谱抗生素或激素，往往继发真菌感染（如酵母类白色念珠菌或新型隐球菌）。将此类患者的尿液接种于沙保罗培养基中，置于37℃或室温，培养5天进行观察。
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